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大多數的肌酸酶同功酶存在于心肌中，少量存在于骨骼肌中，所以臨床上把肌酸酶同功酶當做心肌缺損的標志物，通過對肌酸酶同功酶的檢測，可以明確的判斷是否有急性心梗、急性心肌炎等疾病，還可以診斷是否有骨骼肌損傷、甲減等疾病。