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運動神經元病的病因至今不明。5％的病例可能與遺傳及基因缺陷有關，另外有部分環(huán)境因素，如重金屬鋁中毒等，這些都可能造成運動神經元疾病。產生運動神經元疾病的原因，目前主要理論有神經毒性物質累積，谷氨酸堆積在神經細胞之間，久而久之，造成神經細胞的損傷。線粒體能量代謝異常，神經細胞膜受損。遺傳基因突變，其中SOD1,TDP43等基因已明確。